Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM2O75603 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM2O75603 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM2O75603 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GCM2O75603 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCM2O75603 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCM2O75603 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCM2O75603 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCM2O75603 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCM2O75603 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCM2O75603 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCM2O75603 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM2O75603 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM2O75603 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM2O75603 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM2O75603 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM2O75603 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM2O75603 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM2O75603 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM2O75603 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCM2O75603 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCM2O75603 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCM2O75603 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GCM2O75603 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCM2O75603 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCM2O75603 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCM2O75603 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCM2O75603 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCM2O75603 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCM2O75603 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCM2O75603 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCM2O75603 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCM2O75603 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCM2O75603 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCM2O75603 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCM2O75603 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCM2O75603 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCM2O75603 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCM2O75603 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCM2O75603 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCM2O75603 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCM2O75603 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCM2O75603 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM2O75603 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM2O75603 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM2O75603 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM2O75603 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM2O75603 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM2O75603 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCM2O75603 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM2O75603 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM2O75603 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM2O75603 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM2O75603 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM2O75603 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCM2O75603 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCM2O75603 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCM2O75603 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCM2O75603 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCM2O75603 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCM2O75603 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCM2O75603 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCM2O75603 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCM2O75603 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM2O75603 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM2O75603 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM2O75603 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM2O75603 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM2O75603 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM2O75603 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM2O75603 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM2O75603 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCM2O75603 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCM2O75603 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCM2O75603 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCM2O75603 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM2O75603 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM2O75603 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM2O75603 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM2O75603 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM2O75603 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM2O75603 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM2O75603 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCM2O75603 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCM2O75603 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCM2O75603 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCM2O75603 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCM2O75603 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM2O75603 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM2O75603 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM2O75603 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM2O75603 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM2O75603 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM2O75603 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCM2O75603 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCM2O75603 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCM2O75603 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCM2O75603 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCM2O75603 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms