Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX3O75364 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX3O75364 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX3O75364 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX3O75364 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX3O75364 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX3O75364 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX3O75364 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PITX3O75364 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX3O75364 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX3O75364 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX3O75364 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX3O75364 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX3O75364 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX3O75364 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX3O75364 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX3O75364 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX3O75364 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX3O75364 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX3O75364 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX3O75364 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX3O75364 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX3O75364 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX3O75364 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX3O75364 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX3O75364 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX3O75364 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX3O75364 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX3O75364 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX3O75364 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX3O75364 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX3O75364 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX3O75364 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX3O75364 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX3O75364 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX3O75364 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX3O75364 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX3O75364 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX3O75364 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX3O75364 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX3O75364 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX3O75364 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX3O75364 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX3O75364 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX3O75364 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX3O75364 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX3O75364 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX3O75364 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX3O75364 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX3O75364 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX3O75364 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX3O75364 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX3O75364 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX3O75364 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX3O75364 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX3O75364 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX3O75364 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX3O75364 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX3O75364 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PITX3O75364 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PITX3O75364 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PITX3O75364 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX3O75364 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX3O75364 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX3O75364 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms