Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
DEPDC5O75140 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
DEPDC5O75140 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
DEPDC5O75140 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
DEPDC5O75140 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
DEPDC5O75140 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms