Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SGTAO43765 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGTAO43765 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGTAO43765 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGTAO43765 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGTAO43765 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SGTAO43765 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTAO43765 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTAO43765 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTAO43765 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTAO43765 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTAO43765 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTAO43765 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTAO43765 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTAO43765 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SGTAO43765 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGTAO43765 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SGTAO43765 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGTAO43765 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGTAO43765 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGTAO43765 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SGTAO43765 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGTAO43765 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGTAO43765 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGTAO43765 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGTAO43765 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SGTAO43765 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGTAO43765 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGTAO43765 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGTAO43765 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SGTAO43765 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SGTAO43765 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGTAO43765 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SGTAO43765 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGTAO43765 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGTAO43765 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGTAO43765 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGTAO43765 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGTAO43765 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SGTAO43765 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTAO43765 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTAO43765 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTAO43765 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTAO43765 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTAO43765 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTAO43765 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTAO43765 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTAO43765 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SGTAO43765 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGTAO43765 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SGTAO43765 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGTAO43765 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGTAO43765 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SGTAO43765 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SGTAO43765 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SGTAO43765 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGTAO43765 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGTAO43765 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SGTAO43765 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SGTAO43765 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTAO43765 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTAO43765 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTAO43765 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTAO43765 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTAO43765 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTAO43765 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTAO43765 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SGTAO43765 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGTAO43765 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGTAO43765 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGTAO43765 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGTAO43765 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGTAO43765 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGTAO43765 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SGTAO43765 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGTAO43765 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGTAO43765 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGTAO43765 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGTAO43765 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SGTAO43765 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGTAO43765 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SGTAO43765 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGTAO43765 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGTAO43765 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGTAO43765 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGTAO43765 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SGTAO43765 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGTAO43765 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGTAO43765 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGTAO43765 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGTAO43765 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGTAO43765 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGTAO43765 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SGTAO43765 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGTAO43765 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGTAO43765 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGTAO43765 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGTAO43765 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SGTAO43765 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SGTAO43765 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms