Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51CO43502 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51CO43502 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD51CO43502 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51CO43502 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms