Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIPK2O43353 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIPK2O43353 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIPK2O43353 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms