Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARPC1BO15143 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARPC1BO15143 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms