Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H3BQF6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BQF6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BQF6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
H3BQF6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQF6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQF6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQF6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQF6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQF6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQF6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQF6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQF6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H3BQF6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQF6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQF6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQF6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQF6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQF6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQF6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQF6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQF6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H3BQF6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQF6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BQF6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQF6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQF6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQF6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQF6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQF6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQF6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BQF6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQF6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQF6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQF6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQF6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQF6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQF6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQF6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H3BQF6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQF6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQF6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQF6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BQF6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQF6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQF6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQF6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQF6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BQF6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BQF6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BQF6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BQF6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BQF6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQF6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQF6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQF6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQF6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQF6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BQF6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQF6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQF6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQF6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQF6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQF6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQF6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQF6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H3BQF6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQF6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BQF6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQF6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQF6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQF6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BQF6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQF6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQF6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQF6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQF6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQF6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQF6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQF6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BQF6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQF6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQF6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQF6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQF6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQF6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BQF6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQF6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQF6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQF6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQF6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BQF6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQF6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQF6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQF6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQF6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BQF6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQF6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQF6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQF6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms