Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRDCB7Z8K6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRDCB7Z8K6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRDCB7Z8K6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms