Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEMP2A6NFY4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEMP2A6NFY4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms