Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM247A6NEH6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM247A6NEH6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM247A6NEH6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms