Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ARL2-SNX15V9GYD0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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