Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
KLF12Q9Y4X4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KLF12Q9Y4X4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms