Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms