Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC12A4Q9UP95 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms