Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PPT2Q9UMR5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms