Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HMGXB4Q9UGU5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGXB4Q9UGU5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms