Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DKK2Q9UBU2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms