Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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