Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL13Q9P2N7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL13Q9P2N7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms