Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms