Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCHIP1Q9P0W5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms