Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms