Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SDHAF3Q9NRP4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SDHAF3Q9NRP4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms