Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms