Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4CQ9C0C4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms