Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
REPIN1Q9BWE0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms