Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms