Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MCMBPQ9BTE3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MCMBPQ9BTE3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms