Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TINF2Q9BSI4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms