Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRBNQ96SW2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRBNQ96SW2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms