Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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