Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms