Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC41A2Q96JW4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC41A2Q96JW4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms