Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC136Q96JN2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms