Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ELP4Q96EB1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ELP4Q96EB1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms