Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NMD3Q96D46 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms