Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SDCCAG3Q96C92 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms