Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATG2BQ96BY7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms