Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
USP9XQ93008 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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USP9XQ93008 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
USP9XQ93008 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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