Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GATA6Q92908 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms