Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PHF3Q92576 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF3Q92576 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms