Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CSRNP3Q8WYN3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms