Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCOLN3Q8TDD5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms