Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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ZNF248Q8NDW4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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ZNF248Q8NDW4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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