Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms