Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AMER3Q8N944 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms