Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms