Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHA9Q7RTU4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHA9Q7RTU4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms