Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRINP3Q76B58 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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